郡部とは、郡という行政区分に属する地域を指します。都道府県内の市部に対する概念で、行政的な区分が基準です。郡の廃置分合により変動し、法律上明確に定義された地域です。
農村部とは、農業を主要産業とし、自然環境に依存した生活が営まれる地域を指します。産業構造と生活形態が基準で、統計調査や社会学の分析で用いられます。経済的・文化的特性に着目した分類です。
郡部は行政的な法的区分であるため客観的で明確ですが、農村部は社会経済的な特性に基づく分類で相対的です。郡部は都市化が進んだ地域も含む場合がありますが、農村部は必ず農業中心の地域を指します。統計や政策では農村部が、行政関係では郡部が使われやすいです。
行政区分や法律的側面を述べる時は郡部を、産業・生活様式・経済格差など社会的側面を述べる時は農村部を使います。統計データでは農村部がより一般的です。