脳の処理は、脳の神経活動全般を指す用語。知覚・思考・感情・記憶・運動制御など、脳が行うあらゆる生理的・化学的処理を含む。より広く、より生物学的な視点で使われる。
認知処理は、脳が情報を受け取り理解・判断・記憶する心理学的なプロセス。知覚・注意・思考・推理・判断など、意識的または無意識的な情報処理機能に限定される。
脳の処理は神経生理学的・物理的レベルの全現象を対象とし、より広範で客観的。認知処理は心理学的・機能的レベルの情報処理を対象とし、より限定的で主観的。脳の処理は感情や無意識の反応も含むが、認知処理は情報の理解・判断といった認知活動に特化している。
生物学的・神経学的な観点なら「脳の処理」、心理学的・情報処理的な観点なら「認知処理」を選ぶ。医学・神経科学では前者、教育・心理学では後者が適切。