呼吸商（RQ）とは、生体が消費する酸素量に対する産生する二酸化炭素量の比率のこと。糖質・脂肪・タンパク質などの栄養素の代謝状況を反映し、栄養学や生化学で使われます。値は栄養素によって異なり、糖質は約1.0、脂肪は約0.7です。
呼吸比とは、一回換気量や分時換気量など、呼吸運動の物理的な容積や頻度の比較のこと。肺機能検査や臨床医学で、健常者と患者の呼吸パターンを比較する際に用いられます。呼吸機能の評価や異常検出に使われます。
呼吸商は生物学的代謝プロセス（何を燃やしているか）を定量化し、栄養状態評価に用いられます。一方、呼吸比は物理的呼吸運動の計測値を比較し、肺機能や呼吸器系の健康状態評価に用いられます。前者は『代謝の質』、後者は『呼吸の量や機能』を表します。
栄養代謝や燃焼物質の判定には呼吸商を、肺機能検査や呼吸運動の機能評価には呼吸比を使います。分野（栄養学か臨床医学か）と対象（代謝か呼吸機能か）で判断してください。