負荷効率とは、与えられた負荷（仕事量・負担）に対して、どの程度の成果や効果が得られたかを示す指標です。同じ仕事量でも結果がどれだけ出ているかに焦点を当てます。リソースの有効活用度を評価する際に用いられ、経営やプロジェクト管理で重要です。
処理効率とは、与えられたタスクや業務を完了するまでの時間や手数がどの程度で済んだかを示す指標です。作業の速度や迅速性に焦点を当てます。製造業や事務作業など、処理スピードが重視される場面で多く使用され、単位時間あたりの出力量を評価します。
使う場面では、負荷効率は成果品質を重視する経営判断や戦略評価に、処理効率は作業スピード重視の現場作業に用いられます。ニュアンスは、負荷効率が「投入に対する見返り」で、処理効率が「時間あたりの処理量」です。対象は、負荷効率が仕事全体の結果、処理効率が個々の作業プロセスです。
成果・結果の質を評価するなら負荷効率、作業の速さ・量を評価するなら処理効率を使用します。戦略的判断には負荷効率、日々の業務改善には処理効率が適切です。