自律システムは、外部の指示や干渉なしに独立して機能・動作する仕組みを指す。ロボットや自動運転車など、プログラムされた規則に基づいて自動的に判断・行動する。人間関係では、他者に依存せず自分の判断で行動する自立性を示す。
自己制御システムは、自らが目標や基準に対して行動を調整・管理する仕組みを指す。感情・欲望・衝動を抑制し、ルール遵守や目標達成に向けて能動的に自らを律する。心理学では自制力や自己規制能力に関連する概念。
自律システムは「自動性・独立性」を強調し、外部に依存せず動作する対象全般に使う。自己制御システムは「能動的な制御・自制」を強調し、主に人間の心理的・行動的調整に使う。前者は装置・機械・組織の独立動作を示し、後者は個人の意志的な自己管理を示す。似ているが、自律は受動的な自動動作も含み、自己制御は常に能動的な意志を前提とする。
独立した動作・自動化を語る場合は「自律システム」、人間の心理的・行動的な自己管理や自制を語る場合は「自己制御システム」を選ぶ。技術系では自律、心理学・教育では自己制御が主流。