種分化とは、進化生物学における現象で、1つの種が環境や地理的隔離を通じて複数の異なる種へ分かれていくプロセス。自然選択や遺伝的浮動により、遺伝的に異なる集団が形成され、やがて交配不可能になる段階を経て新種が誕生する。
分化とは、より広い概念で、均一なものが異なる機能や構造を持つ部分に分かれること。生物学では細胞が異なる役割を持つ組織へ変化する過程、社会学では社会の各部門が専門化する現象を指す。多くの分野で使用される。
種分化は生物学に特化した専門用語で、生物種の形成という狭い対象を指す。分化は細胞の分化、社会的分化、機能分化など広範な領域で使われる包括的な用語。種分化は時間軸が長く大規模な進化過程だが、分化は細胞レベルの短期間の変化も含む。また種分化は新種の誕生を前提とするが、分化は単なる機能分化に留まる場合が多い。
生物の新種形成の話なら種分化を使用。細胞の役割変化、社会の専門化、機能の区別など広い文脈では分化を選ぶ。学術的には種分化は進化生物学、分化は生物学全般や社会学など複数分野で活用される。