深夜とは、夜中の遅い時間帯を指す。一般的には午後11時から翌朝3時頃までの間隔を示す。営業時間、ニュース報道、日常会話で頻繁に使われる。比較的広い時間帯を指し、その時間内なら深夜と呼べる。
真夜中とは、夜中で最も深い時刻、特に午前0時（真夜中12時）付近を指す。より具体的で限定的な時間帯を表す。文学的・感情的な表現として使われやすく、ニュアンス豊かな表現。
使う場面では、深夜は実務的・客観的場面（営業、放送、統計）に用い、真夜中は文学的・情緒的場面に用いる。時間範囲では、深夜が数時間のスパン、真夜中がより限定的。ニュアンスでは、深夜は中立的、真夜中は神秘的・不気味なトーンを持つ。対象では、深夜は時間帯そのもの、真夜中は劇的な瞬間を指すことが多い。
客観的な時間帯や営業時間を述べるなら深夜。文学的表現や劇的な瞬間、より限定的な午前0時付近を指すなら真夜中。感情表現が必要なら真夜中、事実の説明なら深夜を選ぶ。