活性クロマチンとは、遺伝子発現が活発に行われているクロマチン領域を指す。DNAがほぐれた状態にあり、転写因子やRNAポリメラーゼがアクセスしやすい。ヒストン修飾（H3K4me3、H3K9acなど）によって特徴づけられ、積極的に遺伝子が転写されている。
ユークロマチンは常に開かれたクロマチン構造を持つ領域で、一般的に転写活性が高い。ギリシャ語の「真の」を意味する「eu」に由来。DNAがルーズに巻きついた状態で、遺伝子発現に適した環境を提供する。多くの活動的な遺伝子を含む。
活性クロマチンは時間的・条件的に変動する概念で、刺激応答や細胞分化に応じて転写が活性化する領域を指す。一方ユークロマチンはより構造的・恒常的な性質で、常に比較的開いた状態を維持する領域を表す。活性クロマチンはヘテロクロマチン（不活性）との対比で用いられ、ユークロマチンはユークロマチン（常開）とヘテロクロマチン（常閉）の二分法で用いられることが多い。
遺伝子の時間的な転写変化を論じる場合は活性クロマチン、クロマチンの恒常的な構造状態を分類する場合はユークロマチンを用いる。実験で転写活性を測定する際は活性クロマチン、DNA配列の物理的なアクセス性を論じる際はユークロマチンが適切。