権利侵害は、著作権・商標権・肖像権・名誉権など、あらゆる権利が違法に侵害される行為を指す広い概念です。民事上・刑事上の責任が問われる可能性があります。法律全般で使用される汎用的な表現です。
特許侵害は、特許権を保有する者の許可なく、特許技術・発明を無断で製造・販売・使用する行為を指します。知的財産権の中でも特許法に基づく違反で、差止請求や損害賠償請求の対象になります。
権利侵害は包括的な上位概念で、著作権侵害・商標権侵害・肖像権侵害など多岐にわたります。特許侵害はその一種で、特許技術に限定されます。法律分野全般で権利侵害を使い、知的財産権・技術分野では特許侵害と特定して使い分けます。ニュアンスとしては、権利侵害は広く捉えた違反行為、特許侵害はより専門的で技術的な違反を指します。
特定の権利種別が明確な場合は「特許侵害」など具体的に指定します。権利の種別が不明確または複数の権利が関わる場合は「権利侵害」を使うと良いでしょう。技術・発明に関する違反なら特許侵害で確定します。