「果物」は、植物の花が実った部分のうち、食べることを目的とした甘い果実を指します。リンゴ、ミカン、ブドウなど、一般的に生食される食材として認識されているものが該当します。日常会話で最も頻繁に使われる言葉です。
「実」は、植物の花が受粉・受精した後に成熟した部分全般を指す植物学用語です。食用・非食用を問わず、また甘辛を問わず、あらゆる果実が含まれます。より広い範囲と学術的なニュアンスを持ちます。
「果物」は食用で甘い果実に限定される生活用語です。一方「実」は食用非食用を問わず、全ての果実を指します。例えばトマトは果物ではなく野菜ですが、植物学上は「実」です。また「木の実」という表現は「実」でしか使えません。「果物」は商品・食材としての側面を、「実」は植物学的側面を強調します。
食べ物として甘い果実を指す場合は「果物」を使います。植物の果実全般、特に食べられない実や植物学的な文脈では「実」を使うべきです。日常会話では「果物」がより自然です。