整理とは、たくさんのものの中から必要なものと不要なものを分別し、不要なものを取り除くプロセスです。思考や情報、荷物などを分類・選別して、本当に必要な状態にすることが目的です。減らすことや削除することに重点があります。
整頓とは、必要なものを見やすく、使いやすいように秩序立てて配置することです。物の位置を整え、ルールに従って並べることで、機能性と美しさを実現します。配置や順序を整えることに重点があります。
使う場面では、整理は決断が必要な場合（いるかいらないか判断）、整頓は配置が課題の場合（どう並べるか工夫）に用いられます。ニュアンスとして、整理は「引き算」の思考で本質を見極め、整頓は「配置」の思考で効率性を高めます。対象も、整理は概念や情報を含む広い範囲、整頓は主に物理的なものを扱うことが多いです。
「不要なものを減らしたい、選別したい」なら整理を使用。「必要なものを整然と並べたい、見やすくしたい」なら整頓を使用。両方が必要な場合は、まず整理してから整頓する順序が効果的です。