思考とは、脳で考える・判断する・推理するなどの知的活動全般を指します。日常的で一般的な表現で、問題解決や判断など幅広い場面で使用されます。日常会話でも学術的な文脈でも用いられる中立的な言葉です。
思索とは、ある問題や事柄について深くじっくりと考え抜く行為を指します。より高度で内省的な知的活動を含み、哲学的・精神的な営みのニュアンスが強いです。やや書き言葉的で文語的な表現です。
思考は思う・考えるという行為全般を指し、日常的で広い応用範囲があります。一方、思索は深い思考を伴い、じっくりと考え抜く、煮詰める過程を指します。思考は素早い判断にも使えますが、思索は時間をかけた内省的思考に限定されます。また思索は人生・真理・倫理など、より抽象的で根源的なテーマについて考える場合に使われやすいです。
日常的で広範な考える行為なら思考、人生や真理など深いテーマをじっくり考え抜く営みなら思索を選びます。迷ったら思考の方がより一般的で無難です。