不確実とは、ある事柄について確実性が欠け、本当かどうか、起こるかどうかが確定していない状態を指します。確率や可能性の問題で、情報や根拠の不足が原因です。天気予報や試験合格など、未来や現実の確かさについて用います。
曖昧とは、意味や内容、定義や表現がはっきりしていない、ぼんやりしている状態を指します。故意か無意識かに関わらず、理解や解釈が複数できる余地がある状態です。説明や返答が明確でない場合に用います。
不確実は『それが本当に起こるか・事実か』という確実性の度合いが問題であり、曖昧は『その内容が何を意味しているか』という明確さが問題です。使う場面として、不確実は予測や確認が必要な事項（天気、結果）に、曖昧は説明や表現（返答、指示、ルール）に用いられます。対象も異なり、不確実は事象・事実の確かさ、曖昧は言葉・意味の鮮明さです。
確実性・真偽・可能性の問題→不確実。意味・内容・表現の問題→曖昧。『事実がはっきりしない』なら不確実、『説明がはっきりしない』なら曖昧と使い分けましょう。