ヌクレアーゼは核酸を加水分解する酵素の総称です。RNAやDNAの両方を切断できる広い範囲の酵素を指します。リボヌクレアーゼとデオキシリボヌクレアーゼの両方を含む包括的な用語で、生化学研究や遺伝子工学で頻繁に使われます。
デオキシリボヌクレアーゼはDNAに特異的に作用する酵素です。DNAのデオキシリボース糖の構造を認識して、リン酸ジエステル結合を特異的に切断します。制限酵素などはこの酵素に分類され、遺伝子組み換え実験に不可欠です。
ヌクレアーゼは基質特異性が低く、RNA・DNA両方を切断できる酵素全般を指す総称です。デオキシリボヌクレアーゼはDNAのみを切断する特異的な酵素です。使う場面では、ヌクレアーゼは複数の核酸を処理する文脈で、デオキシリボヌクレアーゼはDNA操作の遺伝子工学的な実験で用いられます。
RNA・DNA両方を対象にする場合、または酵素の種類を広く指すときはヌクレアーゼを使用します。DNA特異的な操作や遺伝子工学の実験ではデオキシリボヌクレアーゼを使い分けましょう。