イージス艦とは、アメリカ開発のイージスシステム（統合防空火力管制システム）を搭載した駆逐艦。強力なレーダーで多数の目標を同時追跡し、ミサイルで対応できる高度な防御能力が特徴。日本では「あたご級」「こんごう級」など。
ミサイル駆逐艦は、対艦・対空・対潜ミサイルを主兵装とする駆逐艦の総称。レーダーやミサイルシステムの精度は多様で、イージス艦よりも広い範囲の艦艇を指す。技術レベルは国や時代で異なる。
イージス艦はミサイル駆逐艦の一種ですが、イージスシステムという特定の高度な統合防御システムを搭載していることが必須条件。ミサイル駆逐艦はミサイル兵装を持つすべての駆逐艦を指す広義の概念。イージス艦は高い防空能力で艦隊全体を守り、ミサイル駆逐艦は対艦・防空など多様な役割を持つ。技術的には、イージス艦はより先進的で高価。
日本の自衛隊艦艇を指すなら「イージス艦」が正確。世界の艦艇全般を広く指すなら「ミサイル駆逐艦」。イージス艦は最新技術の具体的な艦を指し、ミサイル駆逐艦は兵装タイプによる分類。